In Moravië liggen alle overige Tjechische wijngaarden, langs de Donau en haar zijrivieren. Moravië is opgesplitst in tien wijngebieden. De drie
belangrijkste zijn:

• Mikulov. Dit gebied is ongeveer 3000 hectare groot en grenst aan het Weinviertel in Oostenrijk. De bodem bevat leisteen. Het belangrijkste wijnbouwcentrum is Pálava. Dit is tevens de naam van een veelgebruikt inheems druivenras.
• Velké Pavlovice. Dit wijngebied omvat ongeveer 2500 hectare. Er komen zoete witte kwaliteitswijnen vandaan. Daarnaast wordt er rode wijn gemaakt. Daarvoor wordt gebruik gemaakt van Portugieser en Blaufränkisch.
• Znojmo (ongeveer 2000 hectare), met als belangrijkste stad Vrbovec. Naast de bovengenoemde druivenrassen is de Sauvignon-druif hier een succes.